可怜的碇真嗣从来没有想过，居然有人可以把EVA玩的这么转，甚至用EVA玩出了人类的体术。而可怜的初号机即使使用了自动驾驶系统，拥有超高的同步率也依然不是断了一臂的三号机对手。
最终暴走的初号机居然被只剩下半条命的三号机干翻在地，甚至四肢都被打了个结，无法动弹。
在制服了暴走的初号机后，三号机的信息识别重新由蓝色变为了红色，这使得碇源渡也没办法再下令歼灭对方。只能就此作罢。
而这惊天大逆转全部都是从三号机被掐断脖子后开始发生的。
本来迟迟得不到楪祈的支援，云启的精神在使徒的侵袭下即将崩溃。
但是恰恰好初号机的攻击使得第十三使徒霰天使在求生本能下，居然放过了和自己的争斗，反倒是和自己一同和初号机进行对抗。
但是一个身体两个意识，本身就无法发挥出全部的力量。所以最终，三号机的脖子还是被初号机掐断了。
感同身受的云启在那一刻第一次体验了死亡的大恐怖，那是瞬间精神脱离肉体的感觉，那是自我意识即将消失的征兆。而第十三使徒霰天使则更加不堪。
本来还算一个整体的意识被活生生打散，只剩下每个个体的独立意识残留在三号机体内。
这些意识庞大而松散，但是毫无统一指挥，只是一盘散沙！
而云启的意识也因为死亡的刺激，瞬间提升到了极致，甚至超过了这个肉体容纳的上限，突破了物理世界的约束，触摸到了三号机体内最神秘的存在，S2机关的内部！
S2机关，又被称为生命果实。那是使徒的象征，象征着某一系生命体进化到终极时获得的永恒生命。
没有人知道为什么S2机关可以提供无穷无尽的生命力，也没有人知道如何制造S2机关，就连这一台搭载在三号机上的S2机关也是NERV回收使徒身上的残骸制造出来的。
但是在三号机被霰天使附身时，这个S2机关被成功激活，和霰天使本身的S2机关融合到一起，成为了双核S2机关。
这也是三号机一启动就暴走的原因之一。双核的S2机关能够提供远超单核的更强大生命能量，启动时产生的AT立场冲击波也更加骇人！
而等到云启的精神离开本体，进入到S2机关后，他才真正的了解到，S2机关根本就不像人们所想像的那样，是一个永动机引擎。它的本质其实是一个通道。
NERV的世界曾经有人研究过S2机关，认为在这个红色球体里面存在一个传说中的迪拉克之海。
这个虚拟的世界还有一个称呼叫做虚数海洋，科学家们一致认为这里是无数正电子互相融合的奇妙世界。
正电子和负电子融合后就成为最基本的能量粒子，而纯粹的能量粒子又会在极短的时间内再次裂变为正电子和负电子。
在真实的世界中，我们只能够找到负电子，而正电子只能够从实验室中创造出来。但是按照能量守恒定律，一定有一个地方容纳了所有的正电子，这个地方就是狄拉克之海。
所以只要连接的这个虚数海洋，人类就能够从其中抽取出无尽的能源，是真正的永动机。
但是当云启的精神力渗透入S2机关后，他才发现，虚数之海的描述依然不准确，这里应该更准确的称呼为虚空之海。
这里是彻底的无之世界，这种无超越了物理范畴，是一种概念上的无，确确实实的什么都没有，连能量都不存在。
S2机关的本质就是打通了一个通往虚空之海的通道，而云启曾经有幸进入过虚空，体验过虚空的感觉。所以他才能立马识别出来，S2机关根本就不是什么永动机，它实质只是一个通道，从这个通道中流出来的就是虚空本身，也可以说是原初的混沌。
虚空什么都不是，也可以什么都是！
狄拉克之海只是它的一种表现形式，在虚空进入世界后就会发生衰变，而这种衰变是随机的，也可以是被人为诱导。如果把它当成狄拉克之海，你就可以获得源源不断的正电子，然后和宇宙中无处不在的负电子发生湮灭反应，释放出巨大的能量。
而将使徒的S2机关之所以能够称为生命之果则是因为，透过这个小孔，流露出来的虚空沾染上了精神力印记，在经过第一次衰变后，这种带有精神印记的能量就成为了等级非常之高的生命能量。所以生命能量的本质就是沾染有精神印记的衰变虚空能。